【劇場版第1作】サイボーグ009
サイボーグ戦士たちが初めて映像化された作品が本作。
世界中に戦争を引き起こし、兵器を売りつける謎の組織「黒い幽霊団（ブラック・ゴースト）」に誘拐され、最強の兵士＝兵器であるサイボーグに改造されてしまった少年・島村ジョー。数々の戦闘テストに合格し、ゼロゼロナンバー9人目の戦士・009となった彼は、同じように改造された8人のサイボーグ戦士たちとともに「黒い幽霊団（ブラック・ゴースト）」からの脱走を試みる。脱走は成功したかに思われたが、仲間の一人、003が敵の手に捕らわれてしまった。再び「黒い幽霊団（ブラック・ゴースト）」へと乗り込んだ009たちは、罠をかい潜り無事003を救出し、敵基地を壊滅させたのだった。
1966年公開。64分。


【劇場版第2作】サイボーグ009　怪獣戦争
世界各地の都市を破壊する巨大怪獣を倒すべく、平和な日常を捨て再び集結したサイボーグ戦士たち。その旅の途中で009は記憶喪失の少女・ヘレナと出会うが、それさえも「黒い幽霊団（ブラック・ゴースト）」の罠だった。怪獣を追い詰めたその先に待っていたのは009の前に立ちはだかるヘレナ。なんと彼女は「黒い幽霊団（ブラック・ゴースト）」のスパイ・サイボーグ0010だったのだ！ ヘレナと対決するものの、彼女にトドメを刺すことができない009。やがて009に命を救われたことで心が動いたヘレナの助力によって、サイボーグ戦士たちは敵基地の爆破に成功し、ついには「黒い幽霊団（ブラック・ゴースト）」の野望を打ち砕いたのであった。
1967年公開。64分。


【劇場版】サイボーグ009超銀河伝説
コマダー星人の宇宙船イシュメールが、地球へと逃亡してきた。中から現れた少年サバは、ダガス星の帝王ゾアに母星を侵略されて脱出した、唯一の生き残りである。全宇宙の支配を企む悪の権化ゾアは、サバの父親コルビン博士とギルモアの友人・コズモ博士、イワンをもさらい、カデッツ要塞星に幽閉した。超エネルギー・ボルテックスを手に入れるため、その知識を持つ者を利用しようというのだ。
博士たちを救出すべく、宇宙へと旅立ったゼロゼロナンバーたちだが、船の修復のために立ち寄った星、ファンタリオンにもゾアの魔手は伸びていた。怪人ロダックに囚われた王女タマラを救い出したのも束の間、ダガス軍の攻撃に、星は全滅させられてしまう。
怒りに燃えてカデッソ要塞星へと潜入する一同だが、ゾアは既に準備を終え、ボルテックスを手に入れるべく出発しようとしていた。ハインリヒはカデッツ要塞星を道連れに特攻、残されたジョーたちはゾアを追い、そこでボルテックスの正体を知るのだった……。
1980年12月20日公開　劇場版アニメ作品